Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01837 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01837 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01837 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01837 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01837 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01837 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01837 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01837 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01837 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01837 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01837 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01837 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01837 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01837 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01837 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01837 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01837 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01837 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01837 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01837 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01837 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01837 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01837 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01837 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01837 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01837 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01837 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01837 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01837 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01837 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01837 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01837 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01837 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01837 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01837 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01837 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01837 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01837 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01837 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01837 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01837 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01837 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01837 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01837 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01837 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01837 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01837 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01837 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01837 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01837 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01837 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01837 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01837 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01837 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01837 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01837 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01837 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01837 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01837 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01837 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01837 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01837 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01837 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01837 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01837 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01837 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01837 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01837 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01837 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01837 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01837 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01837 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01837 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01837 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01837 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01837 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01837 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01837 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01837 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01837 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01837 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01837 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01837 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01837 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01837 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01837 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01837 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01837 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01837 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01837 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01837 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01837 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01837 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01837 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01837 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01837 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01837 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01837 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01837 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms