Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01820 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01820 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01820 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01820 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
P01820 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01820 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01820 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01820 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01820 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01820 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01820 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01820 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01820 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01820 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01820 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01820 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01820 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01820 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01820 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01820 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01820 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01820 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01820 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01820 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01820 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01820 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01820 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01820 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01820 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01820 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01820 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01820 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01820 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01820 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01820 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01820 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01820 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01820 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01820 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01820 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01820 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01820 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01820 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01820 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01820 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01820 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01820 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01820 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01820 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01820 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P01820 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01820 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01820 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01820 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01820 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01820 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01820 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01820 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01820 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01820 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01820 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01820 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01820 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01820 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01820 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01820 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01820 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01820 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01820 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01820 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01820 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01820 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01820 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms