Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01790 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01790 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01790 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01790 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01790 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01790 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01790 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01790 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01790 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01790 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01790 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01790 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01790 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01790 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
P01790 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01790 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01790 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01790 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01790 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01790 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01790 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01790 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01790 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01790 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
P01790 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01790 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01790 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01790 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01790 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01790 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
P01790 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01790 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01790 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01790 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01790 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01790 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01790 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01790 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01790 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01790 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01790 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01790 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01790 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01790 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01790 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01790 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01790 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01790 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01790 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01790 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
P01790 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01790 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01790 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01790 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01790 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01790 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01790 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01790 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01790 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01790 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01790 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01790 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01790 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01790 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01790 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01790 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01790 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01790 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01790 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01790 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01790 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01790 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01790 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01790 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01790 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01790 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01790 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01790 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01790 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01790 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01790 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01790 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01790 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01790 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01790 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01790 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01790 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01790 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01790 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01790 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01790 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01790 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01790 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01790 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
P01790 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01790 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01790 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01790 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01790 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms