Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vti1aO89116 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vti1aO89116 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms