Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Robo1O89026 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Robo1O89026 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Robo1O89026 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Robo1O89026 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Robo1O89026 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Robo1O89026 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Robo1O89026 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Robo1O89026 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Robo1O89026 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Robo1O89026 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Robo1O89026 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Robo1O89026 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Robo1O89026 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Robo1O89026 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Robo1O89026 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Robo1O89026 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Robo1O89026 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Robo1O89026 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Robo1O89026 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms