Protein–RNA interactions for Protein: O88987

Akap3, A-kinase anchor protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap3O88987 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap3O88987 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Akap3O88987 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Akap3O88987 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Akap3O88987 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Akap3O88987 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Akap3O88987 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Akap3O88987 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Akap3O88987 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Akap3O88987 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Akap3O88987 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Akap3O88987 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms