Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx8O88983 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx8O88983 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx8O88983 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx8O88983 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx8O88983 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx8O88983 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx8O88983 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx8O88983 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx8O88983 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx8O88983 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx8O88983 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx8O88983 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx8O88983 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms