Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sema3fO88632 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema3fO88632 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema3fO88632 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms