Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc27a3O88561 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc27a3O88561 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc27a3O88561 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc27a3O88561 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc27a3O88561 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc27a3O88561 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc27a3O88561 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc27a3O88561 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc27a3O88561 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc27a3O88561 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc27a3O88561 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc27a3O88561 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc27a3O88561 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc27a3O88561 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc27a3O88561 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc27a3O88561 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms