Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cops6O88545 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cops6O88545 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cops6O88545 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cops6O88545 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cops6O88545 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cops6O88545 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cops6O88545 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cops6O88545 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cops6O88545 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cops6O88545 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cops6O88545 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cops6O88545 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cops6O88545 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cops6O88545 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms