Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dll3O88516 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dll3O88516 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dll3O88516 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dll3O88516 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dll3O88516 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dll3O88516 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dll3O88516 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms