Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfrO88507 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfrO88507 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfrO88507 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfrO88507 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfrO88507 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfrO88507 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CntfrO88507 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CntfrO88507 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CntfrO88507 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CntfrO88507 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CntfrO88507 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CntfrO88507 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CntfrO88507 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CntfrO88507 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CntfrO88507 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CntfrO88507 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CntfrO88507 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CntfrO88507 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CntfrO88507 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CntfrO88507 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CntfrO88507 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CntfrO88507 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms