Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc4a4O88343 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc4a4O88343 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc4a4O88343 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc4a4O88343 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms