Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb5O70309 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itgb5O70309 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb5O70309 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms