Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmx1O70218 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmx1O70218 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hmx1O70218 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms