Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl35aO55142 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms