Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap2O55126 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap2O55126 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms