Protein–RNA interactions for Protein: O54950

Prkag1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkag1O54950 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkag1O54950 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkag1O54950 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkag1O54950 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkag1O54950 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkag1O54950 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms