Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NlkO54949 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NlkO54949 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NlkO54949 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NlkO54949 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NlkO54949 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NlkO54949 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NlkO54949 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NlkO54949 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NlkO54949 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NlkO54949 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NlkO54949 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NlkO54949 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NlkO54949 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NlkO54949 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NlkO54949 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NlkO54949 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NlkO54949 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NlkO54949 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NlkO54949 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NlkO54949 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NlkO54949 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NlkO54949 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NlkO54949 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NlkO54949 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NlkO54949 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NlkO54949 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NlkO54949 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NlkO54949 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NlkO54949 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NlkO54949 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NlkO54949 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NlkO54949 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NlkO54949 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NlkO54949 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NlkO54949 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NlkO54949 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NlkO54949 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NlkO54949 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NlkO54949 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NlkO54949 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NlkO54949 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NlkO54949 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NlkO54949 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NlkO54949 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NlkO54949 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NlkO54949 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NlkO54949 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NlkO54949 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NlkO54949 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NlkO54949 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NlkO54949 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NlkO54949 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NlkO54949 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NlkO54949 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NlkO54949 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NlkO54949 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NlkO54949 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NlkO54949 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NlkO54949 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NlkO54949 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NlkO54949 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NlkO54949 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NlkO54949 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NlkO54949 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NlkO54949 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NlkO54949 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NlkO54949 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NlkO54949 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NlkO54949 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NlkO54949 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NlkO54949 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NlkO54949 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NlkO54949 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NlkO54949 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NlkO54949 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NlkO54949 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NlkO54949 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NlkO54949 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NlkO54949 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NlkO54949 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NlkO54949 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NlkO54949 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NlkO54949 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NlkO54949 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NlkO54949 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NlkO54949 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NlkO54949 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NlkO54949 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NlkO54949 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NlkO54949 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NlkO54949 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NlkO54949 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NlkO54949 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NlkO54949 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NlkO54949 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NlkO54949 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NlkO54949 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NlkO54949 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NlkO54949 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms