Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarce1O54941 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarce1O54941 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarce1O54941 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarce1O54941 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms