Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb3O54890 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb3O54890 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb3O54890 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms