Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EomesO54839 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EomesO54839 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EomesO54839 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EomesO54839 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EomesO54839 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EomesO54839 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EomesO54839 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EomesO54839 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EomesO54839 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EomesO54839 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EomesO54839 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EomesO54839 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EomesO54839 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EomesO54839 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EomesO54839 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EomesO54839 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EomesO54839 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EomesO54839 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EomesO54839 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EomesO54839 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EomesO54839 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EomesO54839 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EomesO54839 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EomesO54839 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EomesO54839 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EomesO54839 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EomesO54839 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EomesO54839 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EomesO54839 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EomesO54839 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EomesO54839 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EomesO54839 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EomesO54839 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EomesO54839 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EomesO54839 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EomesO54839 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EomesO54839 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EomesO54839 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EomesO54839 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EomesO54839 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EomesO54839 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EomesO54839 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EomesO54839 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EomesO54839 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EomesO54839 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EomesO54839 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EomesO54839 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EomesO54839 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EomesO54839 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EomesO54839 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EomesO54839 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EomesO54839 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EomesO54839 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EomesO54839 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EomesO54839 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EomesO54839 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EomesO54839 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EomesO54839 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EomesO54839 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EomesO54839 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EomesO54839 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EomesO54839 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EomesO54839 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EomesO54839 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EomesO54839 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EomesO54839 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EomesO54839 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EomesO54839 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EomesO54839 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EomesO54839 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EomesO54839 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EomesO54839 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EomesO54839 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EomesO54839 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EomesO54839 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EomesO54839 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EomesO54839 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EomesO54839 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EomesO54839 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EomesO54839 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EomesO54839 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EomesO54839 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EomesO54839 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EomesO54839 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EomesO54839 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EomesO54839 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EomesO54839 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms