Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpd52l1O54818 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpd52l1O54818 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpd52l1O54818 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms