Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxO54751 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxO54751 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxO54751 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxO54751 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxO54751 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxO54751 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxO54751 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxO54751 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxO54751 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxO54751 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxO54751 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxO54751 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxO54751 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxO54751 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxO54751 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxO54751 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxO54751 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxO54751 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxO54751 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxO54751 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxO54751 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxO54751 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxO54751 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxO54751 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxO54751 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxO54751 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxO54751 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxO54751 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxO54751 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxO54751 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxO54751 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxO54751 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxO54751 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxO54751 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxO54751 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxO54751 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxO54751 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrxO54751 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxO54751 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxO54751 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxO54751 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxO54751 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxO54751 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrxO54751 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrxO54751 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrxO54751 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxO54751 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxO54751 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxO54751 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrxO54751 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxO54751 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxO54751 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxO54751 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxO54751 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxO54751 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxO54751 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrxO54751 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxO54751 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxO54751 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxO54751 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxO54751 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxO54751 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxO54751 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxO54751 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrxO54751 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrxO54751 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrxO54751 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrxO54751 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrxO54751 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrxO54751 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrxO54751 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrxO54751 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrxO54751 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrxO54751 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrxO54751 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrxO54751 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrxO54751 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrxO54751 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrxO54751 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrxO54751 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrxO54751 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrxO54751 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrxO54751 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrxO54751 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrxO54751 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrxO54751 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrxO54751 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CrxO54751 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms