Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CaluO35887 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CaluO35887 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CaluO35887 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CaluO35887 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CaluO35887 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CaluO35887 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CaluO35887 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CaluO35887 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CaluO35887 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CaluO35887 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CaluO35887 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CaluO35887 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CaluO35887 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CaluO35887 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CaluO35887 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CaluO35887 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CaluO35887 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CaluO35887 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CaluO35887 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CaluO35887 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CaluO35887 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CaluO35887 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CaluO35887 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CaluO35887 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CaluO35887 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CaluO35887 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CaluO35887 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CaluO35887 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CaluO35887 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CaluO35887 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CaluO35887 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CaluO35887 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CaluO35887 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CaluO35887 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CaluO35887 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CaluO35887 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaluO35887 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaluO35887 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaluO35887 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaluO35887 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaluO35887 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaluO35887 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaluO35887 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaluO35887 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CaluO35887 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CaluO35887 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CaluO35887 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CaluO35887 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CaluO35887 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CaluO35887 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CaluO35887 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CaluO35887 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CaluO35887 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CaluO35887 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CaluO35887 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CaluO35887 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CaluO35887 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CaluO35887 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CaluO35887 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CaluO35887 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CaluO35887 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CaluO35887 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CaluO35887 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CaluO35887 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CaluO35887 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CaluO35887 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CaluO35887 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaluO35887 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaluO35887 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaluO35887 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaluO35887 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaluO35887 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaluO35887 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaluO35887 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaluO35887 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaluO35887 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CaluO35887 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CaluO35887 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CaluO35887 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CaluO35887 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CaluO35887 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CaluO35887 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CaluO35887 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaluO35887 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaluO35887 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaluO35887 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaluO35887 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaluO35887 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaluO35887 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaluO35887 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaluO35887 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaluO35887 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CaluO35887 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CaluO35887 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CaluO35887 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CaluO35887 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CaluO35887 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CaluO35887 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CaluO35887 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms