Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops5O35864 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops5O35864 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops5O35864 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops5O35864 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cops5O35864 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops5O35864 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops5O35864 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops5O35864 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops5O35864 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops5O35864 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops5O35864 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.3 ms