Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc1O35704 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms