Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phox2bO35690 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phox2bO35690 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phox2bO35690 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phox2bO35690 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phox2bO35690 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phox2bO35690 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phox2bO35690 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phox2bO35690 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phox2bO35690 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phox2bO35690 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phox2bO35690 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Phox2bO35690 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms