Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppef2O35385 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppef2O35385 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms