Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kpna3O35344 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kpna3O35344 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kpna3O35344 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna3O35344 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms