Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srsf5O35326 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf5O35326 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srsf5O35326 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms