Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad6O35182 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad6O35182 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad6O35182 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smad6O35182 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad6O35182 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad6O35182 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad6O35182 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad6O35182 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smad6O35182 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad6O35182 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad6O35182 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad6O35182 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms