Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc23O35125 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc23O35125 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms