Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcm2O09102 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcm2O09102 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcm2O09102 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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