Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EllO08856 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EllO08856 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EllO08856 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EllO08856 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EllO08856 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EllO08856 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EllO08856 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EllO08856 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EllO08856 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EllO08856 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EllO08856 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EllO08856 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EllO08856 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EllO08856 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EllO08856 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EllO08856 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EllO08856 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EllO08856 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EllO08856 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EllO08856 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EllO08856 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EllO08856 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EllO08856 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EllO08856 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EllO08856 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EllO08856 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EllO08856 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EllO08856 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EllO08856 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EllO08856 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EllO08856 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EllO08856 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EllO08856 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EllO08856 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EllO08856 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EllO08856 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EllO08856 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EllO08856 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EllO08856 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EllO08856 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EllO08856 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EllO08856 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EllO08856 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EllO08856 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EllO08856 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EllO08856 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EllO08856 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EllO08856 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EllO08856 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EllO08856 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EllO08856 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EllO08856 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EllO08856 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EllO08856 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EllO08856 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EllO08856 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EllO08856 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EllO08856 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EllO08856 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EllO08856 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EllO08856 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EllO08856 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EllO08856 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EllO08856 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EllO08856 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EllO08856 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EllO08856 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EllO08856 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EllO08856 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EllO08856 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EllO08856 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EllO08856 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EllO08856 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EllO08856 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EllO08856 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EllO08856 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EllO08856 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EllO08856 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EllO08856 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EllO08856 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EllO08856 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EllO08856 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EllO08856 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EllO08856 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EllO08856 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EllO08856 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EllO08856 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EllO08856 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EllO08856 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EllO08856 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EllO08856 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EllO08856 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EllO08856 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EllO08856 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EllO08856 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EllO08856 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EllO08856 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EllO08856 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EllO08856 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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