Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gfra2O08842 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gfra2O08842 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfra2O08842 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfra2O08842 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms