Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrkcshO08795 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PrkcshO08795 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrkcshO08795 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms