Protein–RNA interactions for Protein: O08792

Ebf2, Transcription factor COE2, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf2O08792 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ebf2O08792 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms