Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dctn1O08788 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Dctn1O08788 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dctn1O08788 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dctn1O08788 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Dctn1O08788 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dctn1O08788 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dctn1O08788 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dctn1O08788 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dctn1O08788 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Dctn1O08788 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dctn1O08788 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dctn1O08788 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dctn1O08788 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dctn1O08788 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dctn1O08788 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dctn1O08788 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Dctn1O08788 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Dctn1O08788 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dctn1O08788 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dctn1O08788 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Dctn1O08788 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dctn1O08788 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dctn1O08788 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Dctn1O08788 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dctn1O08788 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dctn1O08788 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms