Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MttpO08601 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MttpO08601 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MttpO08601 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MttpO08601 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MttpO08601 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MttpO08601 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MttpO08601 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MttpO08601 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MttpO08601 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MttpO08601 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MttpO08601 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MttpO08601 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MttpO08601 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MttpO08601 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MttpO08601 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MttpO08601 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MttpO08601 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MttpO08601 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MttpO08601 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MttpO08601 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MttpO08601 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MttpO08601 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MttpO08601 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MttpO08601 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MttpO08601 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MttpO08601 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MttpO08601 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MttpO08601 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MttpO08601 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MttpO08601 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MttpO08601 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MttpO08601 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MttpO08601 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MttpO08601 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MttpO08601 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MttpO08601 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MttpO08601 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MttpO08601 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MttpO08601 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MttpO08601 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MttpO08601 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MttpO08601 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MttpO08601 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MttpO08601 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MttpO08601 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MttpO08601 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MttpO08601 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MttpO08601 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MttpO08601 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MttpO08601 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MttpO08601 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MttpO08601 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MttpO08601 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MttpO08601 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MttpO08601 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MttpO08601 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MttpO08601 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MttpO08601 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MttpO08601 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MttpO08601 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MttpO08601 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MttpO08601 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MttpO08601 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MttpO08601 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MttpO08601 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MttpO08601 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MttpO08601 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MttpO08601 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MttpO08601 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MttpO08601 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MttpO08601 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MttpO08601 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MttpO08601 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MttpO08601 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MttpO08601 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MttpO08601 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MttpO08601 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MttpO08601 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MttpO08601 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MttpO08601 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MttpO08601 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MttpO08601 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MttpO08601 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MttpO08601 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MttpO08601 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MttpO08601 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MttpO08601 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MttpO08601 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MttpO08601 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MttpO08601 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MttpO08601 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MttpO08601 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MttpO08601 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MttpO08601 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MttpO08601 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MttpO08601 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MttpO08601 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MttpO08601 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MttpO08601 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms