Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna3O08545 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna3O08545 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efna3O08545 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efna3O08545 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efna3O08545 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efna3O08545 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efna3O08545 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efna3O08545 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efna3O08545 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna3O08545 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms