Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vmn2r78K7N6U5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vmn2r78K7N6U5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn2r78K7N6U5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms