Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm2056J3QQ02 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2056J3QQ02 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2056J3QQ02 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms