Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5849J3QPE5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5849J3QPE5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms