Protein–RNA interactions for Protein: J3QP07

B020004C17Rik, RIKEN cDNA B020004C17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004C17RikJ3QP07 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B020004C17RikJ3QP07 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B020004C17RikJ3QP07 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
B020004C17RikJ3QP07 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B020004C17RikJ3QP07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 749.5 ms