Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smim18J3QNP2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim18J3QNP2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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