Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm21060J3KMU4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21060J3KMU4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21060J3KMU4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21060J3KMU4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21060J3KMU4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21060J3KMU4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21060J3KMU4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21060J3KMU4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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