Protein–RNA interactions for Protein: G5E8S3

E230025N22Rik, Riken cDNA E230025N22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E230025N22RikG5E8S3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E230025N22RikG5E8S3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
E230025N22RikG5E8S3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E230025N22RikG5E8S3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms