Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vmn1r67G5E8C1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r67G5E8C1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms