Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
2610008E11RikG3X964 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
2610008E11RikG3X964 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
2610008E11RikG3X964 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
2610008E11RikG3X964 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms